W programie nauczania każdej klasy musi się znaleźć podane niżej tematy lekcji/wykładów:

1. Lekcja organizacyjna
2. Rangi Shinobi
3. Rodzaje broni
4. Podstawowy podział jutsu
5. Walka wręcz(teoria)
6. Walka wręcz(praktyka)
7. Walka z brońmi(teoria)
8. Walka z brońmi(praktyka)
9. Rzuty(teoria)
10. Rzuty(praktyka)
11. Nauka 3 jutsu wybranych przez uczniów
12. SPRAWDZIAN(teoria)
13. SPRAWDZIAN(praktyka)

W skład tych lekcji wchodzą jak widać powyżej zajęcia teoretyczne, praktyczne oraz sprawdziany.
Aby każdy uczeń mógł ukończyć akademię musi zdać wszystkie sprawdziany z oceną co najmniej
"dopuszczającą".